廣東省微生物種質資源庫于2005年6月成立，由廣東省科學技術廳、廣州市科學技術局授牌，依托于廣州市微生物研究所集團股份有限公司管理。

廣東省微生物種質資源庫保藏的微生物菌種有3000多株，覆蓋普通微生物、工業微生物、檢測微生物、益生菌微生物、藥用微生物、海洋微生物等，種類類別齊全。 

本菌種庫設施條件齊全，設備先進。建有菌種保藏室、菌種分離鑒定室、菌種制備室、菌種培養室、冷凍干燥室、菌種資料室及標本展覽室等各功能室間；有用于菌種分離純化、傳代、冷凍干燥等專業菌種制備設備，如生化培養箱、顯微鏡及成像系統、厭氧培養箱、真空冷凍干燥機；有用于菌種保藏的設備，超低溫冰箱、液氮罐、大型冷庫等。 

本菌種庫能為客戶提供菌種鑒定、傳代、制種、保藏等服務內容，能夠根據客戶需求訂制服務內容。本菌種庫常與科研院所、高校、企業及社會其他資源單位進行資源共享，為教學、科研和生產提供標準菌種、測試菌種及生產菌種，為社會提供相關服務。 

本菌種庫長期跟國內外菌種保藏機構進行菌株交流合作，如美國典型培養物保藏中心（ATCC）、德國國家微生物菌種保藏中心（DSMZ）、中國普通微生物菌種保藏中心（CGMCC）、中國工業微生物菌種保藏中心（CICC）、中國醫學微生物菌種保藏中心（CMCC）等多家保藏機構有合作交流，為華南地區高校院所，如中山大學、華南理工大學、華南農業大學、暨南大學、廣東省農科院等提供過菌株服務。